|
Flavonoid là một nhóm hợp chất lớn thường gặp trong
thực vật và cho đến nay đã có trên 4000 chất đã được xác định cấu trúc. Nhiều
công trình nghiên cứu đã chứng minh flavonoid có tác dụng sinh học đa dạng như
kháng viêm, kháng dị ứng, chống ung thư, và làm giảm nguy cơ mắc các bệnh tim
mạch; những hoạt tính sinh học này chủ yếu liên quan đến khả năng chống gốc tự
do của flavonoid. Từ đó, đã có nhiều đề tài nghiên cứu về liên quan cấu trúc và
tác dụng chống oxy hóacủa flavonoid, tuy nhiên có rất ít công trình nghiên cứu
liên quan cấu trúc và tác dụng chống oxy hóa mang tính chất định lượng QSAR và
nếu có cũng chỉ xây dựng mô hình QSAR trên một vài nhóm hợp chất của flavonoid
như flavon, flavonol hay flavanon với số lượng hợp chất không nhiều. Nhằm góp
phần định hướng thiết kế cũng như dự đoán tác dụng chống oxy hóa của các hợp
chất flavonoid nói chung và các chất tự nhiên nói riêng, đề tài được thực hiện với
mục tiêu xây dựng mô hình dự đoán hoạt tính chống oxy hóa của các dẫn chất
flavonoid - áp dụng sàng lọc trên cơ sở dữ liệu các chất tự nhiên và nhóm chất
chalcon.
Phương pháp nghiên cứu
- Quy trình thực hiện:
Theo sơ đồ.
- Chuẩn bị cơ sở dữ liệu:
248 hợp chất.
- Tính toán thông số mô
tả phân tử: Bằng phần mềm MOE 2008.10.
- Phân chia tập hợp: Phương
pháp phân chia đa dạng và ngẫu nhiên.
- Lọc thô thông số mô tả;
Chia tỉ lệ thông số mô tả; Chọn lọc thông số mô tả.
- Xây dựng mô hình; Đánh
giá mô hình.
- Đánh giá ROY.
Kết quả
Nghiên cứu đã xây dựng thành công mô hình 2D-QSAR dựa
trên 248 hợp chất flavonoid được thử hoạt tính chống oxy hóa theo phương pháp
DPPH. Mô hình được ứng dụng để sàng lọc ảo qua thư viện TCM và thư viện các
chalcon, thu được 37 chất TCM và 17 chalcon có tiềm năng. Kết quả này định
hướng cho thực nghiệm và xác định được giá trị IC50 in vitro của các chalcon.
|