cheap jerseys Wholesale Jerseys Wholesale Jerseys nfl jerseys china wholesale nfl jerseys cheap nhl jerseys wholesale nhl jerseys cheap nba jerseys cheap mlb jerseys wholesale mlb jerseys cheap nike jerseys cheap nike jerseys free shipping cheap authentic nfl nike jerseys nfl football jerseys china cheap authentic football jerseys replica football jerseys cheap football jerseys authentic cheap football jerseys paypal cheap nfl football jerseys wholesale football jerseys cheap china replica football jerseys china nfl jerseys supply cheap replica jerseys china replica football jerseys china cheap jerseys Wholesale Jerseys China wholesale authentic jerseys nfl jerseys from china cheap nfl jerseys china buy cheap nfl jerseys wholesale nfl jerseys china cheap nhl jerseys china wholesale nhl jerseys china cheap nba jerseys china wholesale nba jerseys china cheap mlb jerseys china wholesale mlb jerseys china nike jerseys china cheap nike jerseys with free shipping nfl nike jerseys wholesale cheap custom football jerseys replica nfl football jerseys cheap authentic football jerseys china football jerseys replica replica football jerseys cheap wholesale nfl jerseys supply replica nfl jerseys nike replica nfl jerseys cheap jerseys for sale Wholesale Jerseys From China wholesale sports jerseys nfl jerseys free shipping cheap nfl jerseys from china where to buy cheap nfl jerseys wholesale nfl jerseys from china cheap nhl jerseys from china wholesale nhl jerseys from china cheap mlb jerseys from china wholesale mlb jerseys from china nike jerseys free shipping cheap nike jerseys china discount nfl nike jerseys cheap custom football jerseys cheap football jerseys for sale wholesale football jerseys usa wholesale football jerseys china buy football jerseys from china football jerseys from china wholesale cheap jerseys supply cheap replica sports jerseys replica jerseys nfl wholesale cheap jerseys wholesale jerseys from china free shipping wholesale jerseys supply cheap nfl jerseys wholesale cheap nfl jerseys paypal wholesale nfl jerseys paypal cheap nhl jerseys wholesale nhl hockey jerseys wholesale cheap nba basketball jerseys wholesale basketball jerseys cheap mlb jerseys paypal wholesale mlb jerseys paypal wholesale nike jerseys paypal wholesale authentic nike jerseys wholesale nfl nike jerseys china custom college football jerseys where to buy football jerseys cheap youth replica football jerseys cheap football jerseys kids cheap football jerseys nike authentic football jerseys wholesale nike football jerseys wholesale cheap blank football jerseys cheap nfl jerseys supply replica jerseys china wholesale replica jerseys cheap replica nfl football jerseys cheap nfl jerseys free shipping where to get cheap nfl jerseys wholesale nhl jerseys free shipping cheap nba jerseys free shipping wholesale nba jerseys cheap cheap mlb jerseys free shippping wholesale mlb jerseys free shipping wholesale nike jerseys cheap nike jerseys wholesale nfl nike jerseys china custom youth football jerseys cheap wholesale football jerseys cheap football jerseys for women wholesale cheap football jerseys football jerseys cheap authentic nfl football jerseys china wholesale jerseys supply wholesale replica jerseys cheap replica throwback jerseys football replica jerseys cheap authentic jerseys Wholesale Nike NFL Jerseys nfl jerseys supply cheap nfl jerseys online cheap nfl nike jerseys wholesale nfl jerseys cheap cheap nhl jerseys online wholesale nhl jerseys paypal cheap stitched nba jerseys wholesale nba basketball jerseys wholesale mlb jerseys usa wholesale nike jerseys china cheap wholesale nfl nike jerseys wholesale nike football jerseys cheap throwback football jerseys wholesale kids football jerseys wholesale football jerseys suppliers authentic football jerseys for cheap wholesale ladies football jerseys cheap football jerseys with free shipping supply cheap jerseys reviews cheap youth replica jerseys nfl jerseys replica cheap nfl jerseys usa cheap nfl jerseys from china wholesale authentic nfl jerseys cheap nhl jerseys wholesale hockey jerseys cheap nba authentic jerseys authentic nba jerseys wholesale cheap mlb replica jerseys wholesale mlb baseball jerseys nike jerseys cheap jerseys china chinese nfl nike jerseys wholesale blank football jerseys cheap throwback football jerseys for sale cheap football jerseys stitched wholesale football jerseys youth wholesale nfl nike football jerseys womens football jerseys wholesale supply jerseys cheap kids replica jerseys replica sports jerseys wholesale cheap jerseys canada wholesale jerseys usa Wholesale Jerseys From China nfl jerseys china wholesale cheap nfl authentic jerseys cheap nfl jerseys wholesale wholesale nike nfl jerseys cheap nhl jerseys canada china wholesale nhl jerseys cheap retro nba jerseys buy cheap jerseys online nba cheap custom mlb jerseys wholesale baseball jerseys nike jerseys wholesale chinese wholesale nike jerseys cheap nfl nike jerseys china blank football jerseys wholesale wholesale nfl football jerseys wholesale nfl football jerseys from china wholesale football jerseys from china wholesale youth nfl football jerseys wholesale nike nfl football jerseys china football jerseys wholesale wholesale jerseys supply reviews wholesale jerseys replica wholesale nike jerseys paypal cheap nfl nike jerseys from china cheap youth practice football jerseys cheap wholesale jerseys discount nfl football jerseys wholesale nike elite football jerseys wholesale replica football jerseys cheap stitched football jerseys wholesale nfl jerseys supply review wholesale replica jerseys china cheap nfl replica jerseys replica nfl jerseys China Wholesale Jerseys wholesale authentic football jerseys cheap jerseys paypal cheap ncaa jerseys paypal cheap mlb jerseys paypal chinese wholesale jerseys nike football jerseys china cheap nike jerseys usa Wholesale Jerseys China nfl football jerseys discount cheap football jerseys online nfl jerseys cheap china replica nfl jerseys wholesale china nike jerseys cheap football jerseys cheap replica nfl jerseys nfl replica jerseys china wholesale jerseys usa cheap replica football jerseys replica nfl jerseys china Wholesale Jerseys From China football jerseys wholesale china youth football jerseys wholesale nfl jerseys china wholesale nike jerseys wholesale cheap china nfl nike jerseys cheap nfl authentic jerseys wholesale nhl hockey jerseys cheap nba jerseys for sale cheap nfl jerseys wholesale wholesale jerseys nhl cheap nba jerseys online wholesale nike nfl jerseys cheap wholesale nfl jerseys where to buy cheap nhl jerseys cheap nhl jerseys canada cheap stitched nfl jerseys cheap nike nfl jerseys china wholesale nhl jerseys buy wholesale jerseys nfl jerseys china cheap cheap retro nba jerseys cheap replica jerseys cheap wholesale jerseys from china buy cheap jerseys online nba cheap youth football jerseys cheap fake football jerseys cheap custom mlb jerseys nfl wholesale nike jerseys cheap custom football jerseys nike jerseys wholesale cheap nba jerseys wholesale cheap authentic nba jerseys cheap jerseys from china buy cheap jerseys from china cheap nike nfl jerseys cheap sports jerseys Wholesale Jerseys China buy wholesale jerseys wholesale authentic jerseys nfl jerseys from china cheap nfl jerseys china cheap nfl jerseys usa cheap nike nfl jerseys nfl jerseys from china nfl jerseys supply nfl jerseys cheap china authentic nfl jerseys wholesale custom nfl jerseys cheap customized nfl jerseys cheap china nfl jerseys cheap cheap official nfl jerseys super bowl jerseys nike super bowl jerseys buy super bowl jerseys wholesale super bowl XLIX jerseys super bowl 49 jerseys wholesale super bowl jerseys sale super bowl jerseys from china 2015 super bowl jerseys form china where to buy super bowl jerseys cheap nfl draft jerseys nfl super bowl jerseys nike super bowl jerseys super bowl 49 jerseys cheap super bowl jersey super bowl 49 jerseys wholesale nfl super bowl XLIX jerseys super bowl 49 jerseys patch 2015 super bowl jerseys form china nike nfl draft jerseys wholesale blank jerseys cheap blank football jerseys wholesale wholesale youth football practice jerseys cheap jerseys authentic reviews supply cheap jerseys reviews cheap stitched jerseys for kids wholesale replica jerseys china wholesale jerseys for women cheap jerseys online free shipping buy wholesale jerseys china nike jerseys cheap cheap sports jerseys and hats wholesale jerseys and hats cheap kids jerseys china cheap sports jerseys china wholesale jerseys china nike wholesale cheap jerseys usa cheap jerseys from china kids cheap jerseys wholesale usa cheap wholesale jerseys authentic super bowl jerseys nike super bowl jerseys buy super bowl jerseys cheap super bowl jerseys super bowl jerseys wholesale super bowl jerseys china cheap nfl super bowl jerseys fake super bowl jerseys where to buy super bowl jerseys cheap nfl draft jerseys cheap nfl jerseys cheap mlb jerseys cheap nfl jerseys paypal wholesale nfl jerseys cheap wholesale nfl jerseys cheap nhl jerseys online cheap hockey jerseys wholesale hockey jerseys cheap stitched nba jerseys cheap nba jerseys wholesale nba jerseys cheap mlb jerseys cheap nike jerseys nfl jerseys from china cheap nfl jerseys supply wholesale nike jerseys nfl jerseys china wholesale wholesale nfl jerseys cheap nhl jerseys cheap nhl jerseys cheap nba jerseys cheap nba jerseys cheap mlb jerseys replica sports jerseys cheap jerseys buy cheap jerseys china cheap jerseys cheap jerseys paypal Wholesale Jerseys wholesale jerseys usa wholesale sports jersey nfl jerseys china cheap nfl jerseys free shipping cheap nfl jerseys buy cheap nfl jerseys wholesale nfl jerseys wholesale authentic nfl jerseys cheap nhl jerseys cheap mlb jerseys wholesale cheap nfl jerseys cheap jerseys from china buy cheap jerseys china cheap jerseys cheap jerseys paypal Wholesale Jerseys wholesale jerseys usa wholesale nba jerseys from china cheap nhl jerseys canada football jerseys for cheap nike super bowl jerseys nhl jerseys china fake oakleys Balenciaga arena high louboutin replica chinese nhl jerseys fake oakley sunglasses Balenciaga black replica louboutin shoes wholesale nhl jerseys fake oakleys White balenciaga shoes replica louboutin wedges cheap nhl jerseys fake oakleys Balenciaga arena suede replica louboutin boots cheap nfl jerseys Balenciaga monochromes cheap red bottom shoes sale cheap super bowl jerseys replica oakley sunglasses balenciaga arena shoe in white replica louboutin shoes wholesale nba jerseys replica louboutin boots fake oakleys Christian louboutin sale nfl jerseys from china cheap louboutin heels fake oakleys Christian louboutin red bottoms wholesale jerseys china nike replica christian louboutin boots fake oakleys Shoes free shipping fake oakley sunglasses Balenciaga mens shoes cheap louboutin pumps cheap nfl nike jerseys fake oakley sunglasses Balenciaga arena sneakers replica louboutin heels cheap nba jerseys china fake oakley sunglasses Red balenciaga sneakers louboutin replica shoes wholesale nba jerseys from china fake oakley sunglasses Balenciaga arena lambskin low Sneakers louboutin replica pumps super bowl jersey shop fake oakley sunglasses stitched jerseys from china cheap red bottom shoes sale cheap oakley sunglasses Louboutin store cheap sports jerseys usa cheap red bottom shoes cheap oakley sunglasses Louboutin shop online cheap stitched nfl jerseys cheap louboutin boots fake oakley sunglasses Mens christian louboutin cheap custom nfl jerseys cheap replica louboutin shoes fake oakley sunglasses Cheap louboutins wholesale pro jerseys replica louboutin heels fake oakley sunglasses Louboutin boutique wholesale nfl jerseys nfl jerseys supply cheap louboutin outlet fake oakleys Christian louboutin mens shoes cheap nfl super bowl jerseys cheap louboutin heels cheap oakley sunglasses Discount louboutin shoes cheap wholesale jerseys authentic cheap louboutin shoes online discount oakley sunglasses giuseppe zanotti for men cheap jerseys from china authentic buy cheap red bottom shoes cheap oakley sunglasses men giuseppe zanotti shoes authentic nfl jerseys wholesale louboutin replica pumps fake oakleys sneakers giuseppe zanotti china nfl jerseys cheap cheap louboutin wedges fake oakleys men giuseppe sneakers cheap official nfl jerseys red bottom shoes for cheap cheap oakleys giuseppe zanotti for men replica oakley sunglasses cheap nike jerseys replica louboutin heels giuseppe zanotti shoe nhl jerseys china cheap louboutin pumps oakley sunglasses discount giuseppe zanotti high tops nfl jerseys from china cheap red bottom shoes sale oakley sunglasses discount shop designer shoes online chinese nhl jerseys cheap louboutin shoes online cheap oakleys giuseppe shoes men wholesale nhl jerseys china cheap louboutin outlet white maison martin margiela margiela high tops wholesale nike jerseys buy cheap nhl jerseys martin margiela sneaker super bowl jerseys china margiela e boutique cheap nfl jerseys louis vuitton mens sneakers cheap mlb jerseys Louis Vuitton trainers cheap jerseys gucci shoes Wholesale Jerseys gucci leather shoes cheap nhl jerseys wholesale soccer jerseys nfl jerseys supply cheap christian louboutin high heels men giuseppe zanotti
QUẢNG CÁO
 
Truy cập
Đang online: 32
Tổng số: 426,067
CHI TIẾT
Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới (NGS) để nghiên cứu Covid-19 (nCoV)
Overview on application of next-generation sequencing (NGS) in Coronavirus SARS-CoV-2 (2019-nCoV)
Đặng Thị Thu Hiền, Phạm Thị Minh Tâm, Trần Việt Hùng
Số: 527 - Tháng 3/2020 - Trang 3-7, 58

Trong thế kỷ này, thế giới phải đối mặt với hai đại dịch do virus Corona có nguồn gốc từ dơi là hội chứng hô hấp cấp tính nặng - còn gọi là SARS-CoV (Severe acute respiratory syndrome coronavirus) và hội chứng hô hấp Trung Đông - còn gọi là MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus). Và gần đây, vào ngày 31 tháng 12 năm 2019, Văn phòng Tổ chức Y tế thế giới (WHO) tại Trung quốc đã ghi nhận trường hợp viêm phổi không rõ nguyên nhân đầu tiên tại thành phố Vũ Hán thuộc tỉnh Hồ Bắc, Trung Quốc. Dịch bệnh không chỉ lan ra ở nhiều địa phương của quốc gia này mà còn lây lan ra các quốc gia và vùng lãnh thổ khác. Các nhà khoa học gọi chủng virus mới là "virus Corona mới 2019" (viết tắt là 2019-nCoV). Đến ngày 11/2/2020, WHO đã công bố tên chính thức của dịch này là Covid-19 và thống nhất tên gọi chính thức cho virus gây bệnh này là "virus Corona hội chứng hô hấp cấp tính nặng 2" (viết tắt là SARS-CoV-2).

Trước diễn biến nghiêm trọng của dịch bệnh, các nghiên cứu về cấu trúc bộ gen và đa dạng di truyền của chủng virus mới là rất cần thiết để phân tích nguồn gốc lây nhiễm và đưa ra các chẩn đoán chính xác. Vì vậy, từ khi xuất hiện trường hợp nhiễm bệnh đầu tiên, các nhà nghiên cứu đã cố gắng xác định chủng virus mới bằng nhiều phương pháp bao gồm phương pháp Sanger và giải trình tự thế hệ mới - NGS (next-generation sequencing). Trong đó, nổi bật là phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới - NGS, cho phép giải trình tự toàn bộ các thông tin di truyền có trong bệnh phẩm, từ đó phát triển các phương pháp xét nghiệm và phân tích đa dạng di truyền của virus gây bệnh.

Ngày 24/01/2020, dữ liệu bộ gen của virus SARS-CoV-2 được giải max bằng phương pháp NGS lần đầu tiên công bố trên Tạp chí Y học New England. Cho đến nay đã có hơn 80 trình tự gen của virus này được giải mã hoàn toàn được công bố trên GISAID và GENBANK. Giải mã các thông tin di truyền đã giúp các nhà khoa học phân tích sâu hơn về sự tiến hóa cũng như đặc điểm di truyền phân tử của SARS-CoV-2 so với các chủng virus Corona khác đã được phát hiện trước đây. Điều này, rất quan trọng trong công tác phát triển vaccin phòng bệnh và chế tạo các xét nghiệm chẩn đoán Covid-19 nhanh.

Bài báo này nhằm giới thiệu về ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới (NGS) để nghiên cứu Covid-19.

Giải trình tự gen thế hệ mới NGS

Bước 1: Tạo thư viện: DNA sẽ được cắt ngắn phù hợp theo phương pháp và thường được gắn một đoạn nucleotide và 2 đầu.

Bước 2: Giải trình tự bằng phương pháp tổng hợp: Các thành phần cho phản ứng khuếch đại được thêm vào và xác định nucleotide theo nguyên lý của phương pháp.

Bước 3: Ghép nối các đoạn DNA đã được giải trình tự.

Bước 4: Sử dụng các phần mềm tin sinh phân tích dữ liệu trình tự thu được theo mục tiêu nghiên cứu

Ứng dụng trong phát hiện và xác định chủng virus mới gây bệnh Covid-19 bằng thiết bị giải trình tự gen thế hệ mới -NGS

+ Phương pháp lấy mẫu và phân lập virus;

+ Phương pháp tách chiết RNA của virus và chuyển thành cDNA;

+ Giải trình tự NGS;

+ Phân tích kết quả;

Kết luận

Nhờ vào kết quả giải trình tự gen và phân tích phát sinh loài mà các nhà khoa học đã biết virus 2019n-CoV là một chủng virus mới thuộc chi Betacoronavirus, thuộc phân chi Sarbecovirus. Chủng này khác biệt về mặt di truyền với chủng MERS-CoV SARS-CoV nhưng lại có họ hàng gần với hai chủng giống SARS phân lập từ dơi là bat-SL-CoVZC45 và chủng bat-SL-CoVZXC21, được phân lập vào năm 2018 ở phía tây Trung Quốc.

Không chỉ xác định nguồn gốc của virus, phương pháp giải trình tự gen đã giúp các nhà nghiên cứu có cái nhìn rõ ràng về cấu trúc hệ gen, kiểm soát được các đột biến phát sinh, giúp phát triển phương pháp phát hiện virus bằng phương pháp sinh học phân tử khác thông qua mồi và đoạn dò đặc hiệu. Nhờ vậy quá trình phát hiện virus được rút ngắn rất nhiều so với thời gian giải toàn bộ bộ gen của virus. Việc xây dựng mô hình liên kết thụ thể của virus cũng được dự đoán dựa vào kết quả giải trình tự gen, giúp phát triển vaccin phòng bệnh.

Phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới-NGS và các phần mềm tin sinh học đã nâng cao sự hiểu biết về nguồn gốc và cơ chế truyền bệnh, giúp đẩy nhanh việc xác định mầm bệnh và thúc đẩy chia sẻ dữ liệu. Chính điều này đã hỗ trợ con người trong cách giải quyết đối phó với sự bùng phát của các bệnh truyền nhiễm hay đại dịch.

Coronaviruses (CoV, Covid-19) are a large family of viruses that cause illness ranging from the common cold to more severe diseases such as Middle East Respiratory Syndrome (MERS-CoV) and Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS-CoV). Recently, the pneumonia that was detected in Chinese City of Wuhan is caused by a new type of coronavirus confirmed as 2019-nCoV (Covid-19). The severe acute respiratory syndrome coronavirus SARS-CoV-2 (2019-nCoV or Covid-19) outbreak is an important reminder that the global community must strengthen national and international programs for early detection and response to future disease outbreaks. In fact, the virus genome of the nCoV in China was characterized by the next generation sequencing (NGS) technology. The advantage of NGS is the ability of characterizing the full viral genome by enabling phylogenetic characterization without any prior knowledge of the potential family. In turn, understanding the full sequence of the virus genome enables to estimate pathogenicity, track viral evolution, drive vaccine discovery and thereby significantly contributes to formulation and execution of control strategies.

Quay trở lại

Bản quyền thuộc về Tạp chí Dược học – Bộ Y tế

Địa chỉ: 138 A Giảng Võ - Quận Ba Đình - Thành phố Hà Nội

Điện thoại: 04.37367717 – 04.37368367 - E-mail: tapchiduocbyt@gmail.com